Que módulo instalo? Gratuito, Pró ou esse modelo de aplicação?

Independente do caminho escolhido, você sempre deve ter instalado o módulo RicardoMartins_PagSeguro, disponível gratuitamente no Github e no Magento Connect, ele é dependência para o módulo PRÓ.

O módulo PRÓ é o mesmo, independente de ter escolhido pagar mensalmente (R$9,90) ou ter escolhido o modelo de aplicação, que não tem mensalidade. O módulo PRÓ acrescenta as opções de pagamento com boleto e TEF(Débito) à sua loja.

As diferenças entre o modelo de aplicação e assinatura são:

Modelo de Aplicação com recebimento em 14 dias ou 30 dias

• Não precisa ter cartão de crédito
• Se não vender nada, não paga nada
• Menos burocracia
• Existe um repasse para o projeto a cada venda realizada porém mesmo com o repasse você paga menos taxas do que se não usasse (a menos que você tenha alguma taxa melhor negociada com o PagSeguro)
•  As taxas tendem a cair cada vez mais devido ao volume de lojas transacionando nesse modelo como já aconteceu diversas vezes.
• *Veja como uma transação de R$250,00 é exibida no seu painel do PagSeguro no modelo 14 dias:
  
  *Modelo de Aplicação com recebimento em 14 dias. Total de taxa(9,13) e repasse(1,85) é de R$10,98, ou 4,39%. Se não utilizasse o módulo, pagaria R$12,47 além da taxa de intermediação.
  Para outros modelos de recebimento consulte este link.

Modelo de Assinatura

• A assinatura é feita usando um cartão de crédito, via pagseguro
• Ideal para lojas com alto faturamento e que possuem taxas menores negociadas com o PagSeguro
• Valor simbólico de R$9,90/mês.
• Nota que neste modelo, caso uma das cobranças não seja aceita pelo seu cartão ou pelo PagSeguro, a chave é suspensa, e uma nova assinatura precisa ser feita.

Em resumo

Se você não possuí nenhuma taxa especial negociada com o PagSeguro, escolha o modelo de aplicação, que sai de graça (se considerar que não tem que pagar nada a mais). A menos que você tenha uma taxa muito menor que as exibidas aqui e um volume muito grande de vendas, o modelo de aplicação é o melhor pra você.

Ambos os módulos são open source, sem criptografia e em todos os casos você estará contribuindo para outros projetos, ong's e afins. Saiba mais.